Mägede nõlvadele ehitatud linna linnastruktuur pidi kohanema maastiku topograafiliste aspektidega, ehkki püüdes austada retikulaarset kuju nagu malelaud.
See aspekt võimaldas lõpuks kasvada mõõdukalt ja harmooniliselt, mis on sajandite jooksul säilitanud oma algse iseloomu. Selle vundament tekkis vajadusest kaitsta ja kaitsta reisijaid, kes sõitsid läbi Zacatecase ja tollase Uus-Hispaania kuningriigi pealinna vahel, vedades peamiselt mineraale ja keda piirasid Chichimeca rahva põlisrahvaste nomaadid. Umbes 1542. aastal tegi Fray Juan de San Miguel rajas praeguse linna lähedusse linna Itzcuinapani nimega, pühendades peaingel San Miguelile kaitsepühaku. Sellel ürgsel elanikkonnal oli lisaks ümbritsevate piirkondade põlisrahvaste tšichimekade pidevatele ja vägivaldsetele rünnakutele tõsiseid probleeme veevarustusega. Sel põhjusel kolisid Villa de San Migueli elanikud asula paar kilomeetrit kirdesse; see oli koht, kus 1555. aastal asutas asevalitseja Don Luis de Velasco taotlusel Villa Á San Miguel el Grande Don Ángel de Villafañe. Samuti nõudis asevalitseja Hispaania elama asumist Hispaania naabritele, kellele antakse maad ja kariloomi, samas kui selles elanud põlisrahvastele antakse austusavaldus andeks ja tulevaste mässude vältimiseks valitseksid nende endi pealikud.
8. märtsil 1826 muutis riigikongress linnaks ja muutis nime, milleks on edaspidi 1779. aastal sündinud kuulsa mässaja auks San Miguel de Allende.
Selle atraktiivse koloniaalpildi sees asuvad mitmed selle aja tõeliselt tähelepanuväärsed paleed. Silmapaistvamate hulgas on munitsipaalpalee, endine raekoda, mis ehitati 1736. aastal. Maja, kus sündis Ignacio Allende, näide linna barokkarhitektuurist, eriti selle fassaadil, ja mis on praegu regionaalmuuseum. Kauni neoklassikalise fassaadiga Casa del Mayorazgo de la Canal valmis 18. sajandi lõpupoole José Mariano de la Canal y Hervas, lepp, dekaan ja kuninglik lipnik. Don Manuel T. de la Canali vana mõisahoone, 1735. aasta ehitus, mis renoveeriti Hispaania kuulsa arhitekti Don Manuel Tolsá projekti järgi 1809. aastal; Praegu asub hoones Allende instituut ja see tõstab esile selle sisehoovide laiust, kaunist kabelit ja erakordseid kaari. Inkvisiitori maja, mis oli Püha kantselei voliniku residents ja mis pärineb aastast 1780. 18. sajandi lõpus ehitatud Marqués de Jaral de Berrio maja ja elegantse fassaadiga Loja krahvide maja.
Mis puutub religioossesse arhitektuuri, siis selles linnas on uhke väärtusega arhitektuuriväärtused, nagu Santo Domingo kirik ja klooster, kaine hoone 1737. aastast. Leal de la Concepcióni klooster, mis on praegu kultuurikeskus, See on tähelepanuväärne hoone oma tohutu terrassiga; Selle ehitas 18. sajandil arhitekt Francisco Martínez Gudlño.
Santa Cruz del Chorro kabel, üks vanimaid; kolmanda ordu tempel, mis pärineb XVII sajandi algusest. San Felipe Neri templi ja oratooriumi kaunis ansambel 18. sajandi algusest; kirikul on roosast karjäärist ülevoolav barokkfassaad, mida kaunistab tugev põliselanike mõju. Selle sisekujunduses on imetlust väärt mööbli, skulptuuride ja maalide vaheldusrikas ja rikkalik kaunistus ning lisaks suurepärasele kujundusele kaunistatud Santa María Manuel'i pühendumusega Santa Casa de Loreto ja selle Camarín de la Virgen suurepärane kabel. Tomás de la kanal. Oratooriumi lähedal on 18. sajandil ehitatud Terviseproua tempel, mille süvistatud fassaadiga kroonib suur kest.
Ka linna kõige atraktiivsemate hulka kuulub 18. sajandist pärit San Francisco tempel oma kauni Churrigueresque fassaadiga ning kuulus kihelkond on peaaegu San Miguel de Allende sümbol; Ehkki selle uusgooti stiilis ehitus on uuem, ehitati see vana 17. sajandi templi struktuurile, austades täielikult selle interjööri ja algset plaani.
Linnale väga lähedal on Atotonilco pühakoda, 13. sajandi kaine proportsiooniga ehitis, mis näeb välja nagu kindlus ja mille sees on säilinud väärtuslikud maalid samast sajandist.
