Calleja oli Vabadussõja ajal keskarmee (1810–12) korraldaja ja pealik ning Uus-Hispaania kuuekümnes asevalitseja, valitses aastatel 1813–1816, olles üks Mehhiko ajaloo suuremaid kaabakaid.
Ta sündis Valladolidis Medina del Campos ja suri Valencias. Esimese kampaania tegi ta teise leitnandina õnnetu Alžiiri ekspeditsioonil, mida juhtis krahv O'Reilly Charles III ajal. Ta oli 100 kadettide, sealhulgas Hispaania järel regendi Joaquín Blacke ja tulevase Buenos Airese asevalitseja Francisco Javier de Elío, Puerto de Santa María sõjakooli õpetaja ja kapten.
Ta saabus Uus-Hispaaniasse koos teise Revillagigedo krahviga (1789) Puebla kindla jalaväerügemendi kaptenina ja viis edukalt läbi mitu komisjoni, kuni ta määrati San Luis Potosí brigaadi ülemaks. Tal oli seal alluvuses vägede kanton, mille käskis koguneda asekuningas Marquina, kelle koos oma kompaniiga osales kapten Ignacio Allende. Seal abiellus ta ka selle linna kuningliku lipniku tütre Doña Francisca de la Gándaraga, kes oli suure Hacienda de Bledose omanik; ja ta omandas suure mõju riigi elanike üle, kes tundsid teda kui "peremeest Don Félixit".
Kui Hidalgo ülestõus tekkis, pani ta asevalitseja käske ootamata oma brigaadi väed relvadele, suurendas neid uutega ning organiseeris ja distsiplineeris, moodustas keskuse väikese (4000 meest), kuid võimsa armee, kes suutis võita Hidalgo ja seisavad silmitsi Morelose alustatud hirmuäratava rünnakuga.
Calleja läks pärast Cuautla piiramist (mai 1812) Mehhikosse tagasi, tema elukohas (Casa de Moncada, hiljem kutsutud Palacio Iturbide) oli tema väike kohus, kus nõustus rahulolematus Venegase valitsuse vastu, keda nad süüdistasid rahapuuduses ja jõuetu revolutsiooni ohjeldada ja lõpetada. Umbes 4 aastat hiljem valitses ta riiki asevalitsejana. Ta täiendas armeed nii, et see jõudis 40 000 liinivägede ja provintside miilitsate ning sama palju rojalistide mehi kõigisse linnadesse ja mõisatesse, lahkudes mõlemad peamiselt revolutsioonis olnud provintsidest; ta korraldas ümber riigikassa, mille tooted kasvasid uute maksudega; sellega taastati kaubaliiklus sagedaste kolonnidega, mis liikusid taas kuningriigi ühest otsast teise, ja tavalise postiteenuse; ning kasvas toimivus ja tollitooted.
See eeldab pidevaid ja intensiivseid kampaaniaid, mida ta mässuliste vastu korraldas ja milles Morelos alistus. Kindla ja hoolimatu mehena ei peatunud ta meedias ega sulgenud silmi tema komandöride poolt toime pandud väärkohtlemiste ees, kui need täitsid tegelikku eesmärki innukalt. Nii muutis ta end kaasaegsete suhtes vihkavaks.
Naastes Hispaaniasse, sai ta Calderóni krahvi tiitli (1818) ning Isabel la Católica ja San Hermenegildo suured ristid. Pärast Andaluusia kindralkapteni ja Cádizi kuberneri ametit juhatas ta Lõuna-Ameerika ekspeditsioonivägesid, kes enne lahkumist üles kerkisid ja vanglasse viisid (1820). Vabastatuna keeldus ta Valencia valitsusest ja vangistati uuesti Mallorcas kuni aastani 1823. "Puhastatud" aastal 1825 viibis ta Valencia kasarmus kuni surmani.
