Sündis Itaalias Comos 1702. aastal üllasena. Hispaaniasse, kuhu ta saabub Austria sõja eest põgenedes, saab ta Mehhiko kuninglikes Cajases Moctezuma järeltulijate pensioni kogumiseks laialdased volitused.
Ta reisis 1736. aastal Uus-Hispaaniasse. Oma viibimise kaheksa aasta jooksul pühendus ta Guadalupe Neitsi ilmingute uurimisele, kogudes märkimisväärset graafilist ja piktograafilist materjali. See soodustab Guadalupani kuvandi kroonimist, mis põhjustab asevalitsejate võimude usaldamatust. Ta võetakse vangi ja tema kollektsioon eemaldati. Kuu aega hiljem asub ta Hispaaniasse küüditatuna laevale, mis satub Gibraltaris teda hülgavate piraatide kätte.
Suurte teostega saabus ta Hispaaniasse ja võttis ühendust kollektsionääri Mariano Fernández de Echeverríay Veytiaga, kes saavutas õigeksmõistmise India kuninglikuks kroonikaks nimetamisel - seisukoha, mille Boturini keeldus pühendumast põlisrahvaste ajaloost kirjutamisele. Ehkki ta pole oma kogu tagasi saanud, kirjutas ta sellele India muuseumi kataloogi. Tema töö on väga originaalne ja hästi dokumenteeritud. Ta suri Madridis ebakindlal kuupäeval, aastatel 1750–1755.
